在进行学术论文查重时，不同机构对知网查重收费存在一定差异。一些高校和科研机构可能会有自己的订购套餐，对于本校教师和学生可能会有更优惠的价格；而对于个人用户或其他机构来说，可能需要支付更高的费用。此外，一些商业性质的机构可能会提供更灵活的收费方式，如按次付费或包月包年等，费用也会有所不同。

除了收费差异外，不同机构在知网查重服务中还可能提供不同的附加价值。一些机构可能会提供查重报告的详细解读和建议，帮助用户更好地改进论文质量；而另一些机构可能只提供简单的查重结果，用户需自行分析。因此，在选择知网查重服务机构时，除了关注收费差异外，还应考虑服务质量和附加价值。